
从左至右依次为Jan Kosinski, Julia Mahamid, Georg Zeller。信贷:Photolab / EMBL的
三位EMBL研究人员因其合作项目获得了著名的ERC协同奖助金。来自EMBL汉堡的Jan Kosinski和来自EMBL海德堡的Julia Mahamid因他们的项目“TransFORM”获得了该奖项,他们将分别获得250万欧元和460万欧元的资金,将在六年的时间内使用。来自海德堡EMBL的Georg Zeller因其项目“CartoHostBug”而获得认可,他将在未来六年内获得250万欧元的奖金。
ERC协同奖助金授予由两到四个小组领导组成的小组,他们共同努力,利用不同的技能和资源来解决雄心勃勃的研究问题。
蛋白质是我们细胞的主力,它们的合成是一个精确调控的过程(也称为“翻译”),由复杂的分子机器完成。这种机制主要由称为核糖体和调节蛋白的结构组成,它们以复杂的方式相互作用,并与细胞微环境相互作用。然而,构成蛋白质合成机制的分子复合物主要是在细胞外的孤立环境中研究的。
TransFORM项目旨在解决与这些不同分子复合物的具体组成、它们的意义以及它们在人体细胞内的功能相关的基本问题。协同团队由EMBL小组负责人Julia Mahamid和Jan Kosinski,来自约翰霍普金斯大学的Rachel Green和来自Technische Universit?t Berlin的Juri Rappsilber组成。因此,它汇集了专家在细胞结构生物学方法发展和翻译调节生物学。研究人员将使用多种模型系统,从单细胞到3D类器官,研究翻译机制如何对各种细胞状态和压力源(如病毒感染)做出反应。
“我们收到的ERC协同拨款将为基于细胞内交联质谱和低温电子断层扫描数据的结构建模的创新计算方法的发展铺平道路,”Kosinski说。“与这些技术方面的专家密切合作,确保我们的方法能够有效地解决最紧迫的挑战。虽然我们在ERC项目中的最初重点将放在翻译复合物上,但我们的方法将适用于其他生物系统,从而确保对细胞内结构生物学产生更广泛的影响。”
Mahamid说:“我们的团队旨在协同开发细胞内低温电子断层扫描方法的变革组合,跨尺度成像,结合交联质谱,以及综合结构建模,以解决亚细胞空间原子细节上翻译复合物的多样性。”“只有这样的下一代结构生物学方法,结合高分辨率生物化学和功能分析,才能对这一基本基因表达过程的复杂调控提供详细而全面的理解。”
人类微生物群,由居住在我们体内的数十亿微生物组成,以无数种方式对我们的健康和疾病做出贡献。海德堡EMBL的Georg Zeller团队开发了尖端的计算和成像工具来研究微生物组,以及它是如何通过与宿主的相互作用而形成的。
肠道微生物组通常是通过对微生物群落进行宏基因组测序来研究的,在这个过程中,所有的空间信息——体内特定微生物的位置以及它们与哪些人类细胞相互作用——都丢失了。CartoHostBug项目是Zeller集团与卡罗林斯卡研究所的Eduardo Villablanca、KTH皇家理工学院的Stefania Giacomello和海德堡大学医院的Julio Saez-Rodriguez领导的团队合作的,旨在改变这种状况。它将帮助科学家利用新型成像方法、空间转录组学技术和计算建模技术的结合,研究人类肠道中微生物群-宿主串扰的空间结构。
研究人员的目标是重建健康个体以及炎症性肠病或结肠癌患者肠道中微生物组成和宿主基因表达的变化。利用这些信息,他们将描述由特定微生物物种和宿主细胞占据的局部通信网络和生态位。通过将这些数据与人为干扰该系统的实验结果相结合,研究人员旨在开发肠道生态系统生态位的计算模型,以获得对健康和疾病中宿主-微生物组相互作用的生物学过程的新见解。
泽勒说:“我非常高兴我们得到了资金来实施这个令人兴奋的项目,并与这样一个了不起的团队合作!”“这确实使我们能够在其原生空间背景下获得前所未有的人类肠道微生物组高分辨率视图。我相信空间数据将彻底改变我们目前对微生物-宿主相互作用的理解,这在很大程度上是基于批量测序数据的。”
在ERC的网站上阅读关于今年协同奖助金的完整公告。
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