单克隆抗体是至关重要的治疗药物，因为它们具有高特异性和对表位的结合亲和力(抗体与抗原结合并引发免疫反应的精确位点)。由于抗体的治疗效果与其靶表位密切相关，因此表位表征对于了解抗体的功能至关重要。
然而，用于研究表位的传统方法是缓慢和劳动密集型的。因此，迫切需要更有效的方法来帮助精确和快速地绘制表位，最终加速下一代疗法的发展。
为了弥补这一差距，东京工业大学的研究人员开展了开创性的研究，开发了一种名为Epitope Binning-seq的新平台。他们的研究结果发表在2024年5月28日的《通讯生物学》杂志上。表位Binning-seq，使用抗原表达细胞上的遗传编码查询抗体(qAbs)和下一代测序(NGS)来评估表位相似性，允许同时评估多个qAbs而无需单独纯化。
本研究采用在表达HER2的细胞表面显示的查询抗体(qAbs)。通过引入荧光标记的参考抗体(rAbs)并使用流式细胞术分析，研究人员可以区分qAbs掩盖表位的细胞和没有掩盖表位的细胞。
一些qAbs有效地阻断了rAb与抗原的结合，导致没有rAb结合的细胞群体，称为rAb阴性群体。相反，其他qAbs允许rAb与抗原结合，产生与rAb结合的细胞群体，称为rAb阳性群体。
该研究的通讯作者Tetsuya Kadonosono副教授进一步深入了解了他们的研究，他说:“差异结合行为是评估不同抗体之间表位相似性的基础。我们对已分类的rabb阴性群体进行NGS分析，以鉴定并将相似的qAbs分组到表位箱中。这种全面的方法能够有效地分析大量抗体，并根据它们的表位特异性进行分类。”
结果很有希望。表位Binning-seq准确地将抗体分类到不同的表位箱中，为它们的结合模式提供了有价值的见解。在使用模型抗体pertuzumab和曲妥珠单抗的实验中，该方法准确地鉴定和富集特异性qAbs，甚至可以检测到初始丰度非常低的克隆。
该平台将14个qab分类到正确的表位仓中，精度高。这些发现显示了Binning-seq表位通过同时评估数百万个qAbs来简化早期抗体药物开发的潜力，加速了有希望的治疗候选物的识别。
这个平台的好处是显著的。表位Binning-seq简化了表位比较，能够快速识别具有相似结合模式的抗体，潜在地推进靶向和有效的基于抗体的治疗。该方法的大规模评估可以改变抗体表征，使同时评估数百万个qAbs成为可能。
“Binning-seq表位的开发代表了抗体药物发现的重大进步。通过提供一种快速、全面、具有成本效益的方法来评估抗体表位相似性，这种新型平台克服了传统表位分析技术的局限性，”Kadonosono总结道。
本研究的结果突出了该方法在改变早期抗体药物开发和抗体亲和力成熟方面的潜力，为未来更有效的治疗策略铺平了道路。
更多信息:Ning Lin et al .，基于哺乳动物细胞展示和DNA测序的多种抗体表位结合，Communications Biology(2024)。DOI: 10.1038/s42003-024-06363-7期刊信息:通讯生物学由东京工业大学提供引文:新的平台简化了抗体研究中的表位比较(2024年，6月10日)检索自2024年6月10日https://medicalxpress.com/news/2024-06-platform-epitope-comparison-antibody.html本文受版权保护。除为私人学习或研究目的而进行的任何公平交易外，未经书面许可，不得转载任何部分。内容仅供参考之用。
